HMP16SData: Efficient Access to the Human Microbiome Project through Bioconductor | bioRxiv Human Microbiome Project (HMP)のデータセットは使用するのに複雑なバイオインフォマティクス手法が必要であったが、このパッケージによりRのみでHMPデータ…

Google Scholarで"beta-diversity"と"alpha-diversity"を含む論文数を年毎にプロットした。当たり前だけど増えている。beta diversity > alpha diversityなのはどうしてなんでしょうね。

記事を読んだ。 Should you transform RNA-seq data: Log, VST, voom?seqqc.wordpress.com RNA-Seqなどのカウントデータを扱う時の問題点は、外れ値の存在と、heteroscedasticity（不等分散性）である。edgeRやDESeq2を使ってdifferential expression a…