Interest in microbiology

microbiologyに興味のあるMDです。面白そうな論文を紹介していくつもりです。

2022-12-01から1ヶ月間の記事一覧

Extreme valueがあるときのヒートマップ描画

r - how can I avoid extreme when I am trying to plot heatmap of a data - Stack Overflow あまり考えたことが無かったが、データをいじらずに表示するには、確かにこうするしかないか。

eggnog-mapperでデータベース関連のエラー

Error: malformed database schema (prots) - near "WITHOUT": syntax error github.com sqlite3 まわりのエラーらしい。私は3.7.17でエラーが出たが、上記Issueでは3.30.1を利用している。3.8.2以降であれば問題ないという記載もあるが、それ以前のバージョ…

MMseqs2のeggNOGダウンロードでエラー

Finding maximum sequence length and set size.Error: msa2profile died github.com mambaでインストールしていたが、バージョンによってeggNOGがインストールできない。Sourceからインストールすることで解決した。 github.com