Interest in microbiology

microbiologyに興味のあるMDです。面白そうな論文を紹介していくつもりです。

2019-01-01から1年間の記事一覧

HUMAnN2でpaired-end readsを使用する場合

Penalizing such cases would be overly strict: in the absence of a the gene's genomic context, this looks like a perfectly reasonable alignment (READ2 may fall in a non-coding region and not align, or it may align to another [isolated] codi…

細菌叢解析お役立ちリンク集

anonym.hatenablog.jp コチラも参照。 細菌叢解析 http://rpubs.com/CPEL/NMDS veganを使いこなしたい方に。metaMDSを使ったNMDS解析のTutorial 16S f1000research.com これを見ればもう大体分かる。セミナーとか出なくても。。 metagenome genominfo.org 最…

ヒトゲノムのURL

ヒト参照ゲノムのリンク先が変わっていたよというお話。 https://github.com/lh3/bwa/issues/175

GWASとLog変換

www.biostars.org Q: GWASを行う前にフェノタイプの分布が正規分布であることを確認する必要があります。もしフェノタイプがLog変換をしたときのみ正規分布であるとしたらどちらのフェノタイプデータを使う必要があるのでしょうか。 A: 正解はあなたの持って…