ポピュラーなLEfSeですが、アウトプットとして用いられるのは*.resファイルとcladogram、barplotです。肝心の.resファイルのカラムの意味が公式のwikiにも書いていなかった。どこかに書いていないかと思ったらGoogle groupのフォーラムに投稿があった。載せ…

Rob KnightのグループからMicrobe-metabolite interactionをニューラルネットワークを使って学習するツールが公開されている。QIIME2でも使えるとのことだがやはりQIIME2は使いにくい... HuttenhowerのグループからもMelonnPan(Model-based Genomically Info…