プラグインが出ていますね．
ただdevバージョンと違って，最新のPICRUSt2ではフルパイプラインをpicrust2_pipeline.pyで実行可能らしい（https://github.com/picrust/picrust2/wiki/Full-pipeline-script）のでそちらから使った方が簡単かもしれない．
Sequence placement, hidden state predictionも別々にやる場合はQIIME2では対応できなさそう．
inputは憎きbiomではなく，一カラム目がASV，以降のカラムがサンプル毎のAbundanceのTSVでもOKとのことなので安心．
